นอกจากน้ำเสียที่เกิดขึ้นในพื้นที่กรุงเทพฯ แล้ว น้ำเสียที่มาจากจังหวัดข้างเคียงก็เป็นอีกหนึ่ง ปัญหาสำคัญที่ทำให้ประชาชนในพื้นที่เกิดความเดือดร้อน โดยเฉพาะในพื้นที่ฝั่งธนบุรีบริเวณคลอง ภาษีเจริญ ดังนั้น เพื่อแก้ไขปัญหาดังกล่าว กทม. จะศึกษาแนวทางในการทำประตูกั้นน้ำบริเวณ คลองภาษีเจริญ เพื่อกันน้ำเสียและบำบัดก่อนจะเข้ามาในกรุงเทพฯ