กระบวนการตรวจสอบ ทุจริต หรือ การกระทำความผิดของข้าราชการ โดยปกติของ กทม. จะมีการตั้งคณะกรรมการ 3 ชุด ได้แก่ 1) คณะกรรมการสืบสวนข้อเท็จจริง - ทำหน้าที่สอบสวนข้อเท็จจริงว่ามีมูลการกระทำความผิดหรือไม่ 2) คณะกรรมการสอบสวนวินัย - ทำหน้าที่สรุปการรับผิดทางวินัย เช่น การไล่ออก การตัดเงินเดือน 3) คณะกรรมการสอบสวนข้อเท็จจริงรับผิดทางละเมิด - ทำหน้าที่ประเมินมูลค่าความเสียหายของรัฐเพื่อเรียกคืนจากผู้ที่กระทำความผิด ในการปฏิบัติและระเบียบที่ผ่านมา กทม. จะใช้ข้าราชการ กทม. ทำหน้าที่ในคณะกรรมการทั้ง 3 ชุด ซึ่งบางครั้งอาจส่งผลให้เกิดการช่วยเหลือกันขึ้นเนื่องจากเป็นคนจากหน่วยงานเดียวกัน ดังนั้น กทม. จะศึกษาความเหมาะสมในการปรับโครงสร้าง คณะกรรมการทั้ง 3 คณะ ให้มีองค์ประกอบของคณะกรรมการอิสระ จากหน่วยงานที่เกี่ยวข้องกับการป้องกันและปราบกรามการทุจริต เช่น ปปช ปปท ปปป นอกจากนี้ จะมีการศึกษาเกี่ยวกับมาตรฐานโทษทางวินัยที่เกี่ยวข้องกับการทุจริตให้มีความเข้มงวดมากยิ่งขึ้น เช่น การเพิ่มโทษการปรับลดเงินเดือนขึ้นต่ำทั้งในแง่ปริมาณและระยะเวลา เพื่อเพิ่มความโปร่งใส เด็ดขาด และ ยุติธรรมในการตรวจสอบการกระทำความผิดของข้าราชการ กทม.